迄今為止，絕大多數(shù)在人間流行的傳染病病原體都被證實(shí)或高度懷疑來(lái)源于野生動(dòng)物宿主或者媒介生物攜帶病毒的跨種傳播，如埃博拉病毒、拉沙熱病毒和當(dāng)前引起全球大流行的新型冠狀病毒等。以往我們對(duì)野生動(dòng)物攜帶病毒的總體特征缺乏系統(tǒng)性研究，對(duì)其遺傳多樣性、進(jìn)化特征和變異規(guī)律等基礎(chǔ)問(wèn)題缺乏研究，在面對(duì)新發(fā)傳染病暴發(fā)時(shí)，不能快速溯源其源頭，因此，亟需闡明與人類(lèi)新發(fā)傳染病密切關(guān)聯(lián)的野生動(dòng)物及媒介生物攜帶的病毒組特征，加強(qiáng)其基礎(chǔ)病毒學(xué)及病原學(xué)研究，并以此為基礎(chǔ)建立完善的監(jiān)測(cè)、預(yù)警和溯源體系，從而實(shí)現(xiàn)新發(fā)傳染病防控由被動(dòng)轉(zhuǎn)向主動(dòng)的轉(zhuǎn)變，真正將防控關(guān)口前移。

翼手目動(dòng)物（蝙蝠）和嚙齒目動(dòng)物（鼠類(lèi)）數(shù)量多、分布廣，是引發(fā)動(dòng)物源性人類(lèi)新發(fā)傳染病的兩大類(lèi)最主要的哺乳類(lèi)野生動(dòng)物。金奇課題組的吳志強(qiáng)研究員等繼2016年在《ISME Journal》、2018年在《Microbiome》等雜志發(fā)表系列文章初步揭示了全國(guó)范圍內(nèi)代表性蝙蝠和鼠類(lèi)呼吸道/消化道病毒組特征后，在傳染病防治重大科技專項(xiàng)“一帶一路”項(xiàng)目的支持下與泰國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)等東南亞地區(qū)優(yōu)勢(shì)單位合作開(kāi)展了東南亞地區(qū)嚙齒目動(dòng)物攜帶病毒組特征的研究工作，通過(guò)對(duì)覆蓋泰國(guó)、老撾和柬埔寨三國(guó)18個(gè)省30個(gè)物種共計(jì)3284只鼠類(lèi)和食蟲(chóng)類(lèi)等小動(dòng)物的肺組織樣本宏轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析，發(fā)現(xiàn)東南亞地區(qū)的嚙齒目動(dòng)物的病毒涉及98個(gè)病毒科（包含24個(gè)哺乳動(dòng)物病毒科）和多種未分類(lèi)的RNA病毒，鑒定獲得了216個(gè)新病毒種/株。其中一些重要病毒如漢坦病毒、砂粒病毒、白蛉病毒、黃病毒和未分類(lèi)RNA病毒等。

上述研究為國(guó)際上首次針對(duì)東南亞地區(qū)開(kāi)展大范圍、多鼠種的病毒組研究，其結(jié)果不僅有助于全面了解動(dòng)物病毒生態(tài)的多樣性，而且為構(gòu)建動(dòng)物源性傳染病預(yù)警、溯源診治體系提供了重要數(shù)據(jù)，為提升我國(guó)應(yīng)對(duì)境外新的動(dòng)物病毒及可能引發(fā)的新發(fā)傳染病提供了技術(shù)支撐。

該工作得到了國(guó)家科技重大專項(xiàng)（2018ZX10101001和 2018ZX10711001），國(guó)家自然科學(xué)基金（81772228）和中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院醫(yī)學(xué)與健康科技創(chuàng)新工程（2020-I2M-CoV19-010, 2016-I2M-1-014和2017-I2MB&R-12）等項(xiàng)目的資助。