研究表明，全球半個(gè)多世紀(jì)以來(lái)引起新發(fā)傳染病疫情的病原體超過(guò)80%來(lái)源于野生動(dòng)物和媒介生物，且以病毒為主。這些病毒在自然宿主或媒介載體等疫源生物內(nèi)循環(huán)傳播，與其共進(jìn)化并頻繁變異獲得新的生物學(xué)屬性和感染特征，一旦突破物種屏障傳染給人類，往往會(huì)對(duì)人類健康造成巨大威脅。近年來(lái)，盡管全球科學(xué)家已經(jīng)開展了很多針對(duì)野生動(dòng)物和媒介生物攜帶病毒的研究，但是由于大量的數(shù)據(jù)信息散布于各種文獻(xiàn)和序列數(shù)據(jù)庫(kù)中，難以進(jìn)行系統(tǒng)的歸納總結(jié)和進(jìn)一步的深度挖掘，使得我們對(duì)這些疫源生物攜帶病毒的總體狀況和變化特征缺乏全面系統(tǒng)的了解。

鼠類和蝙蝠是地球上種群最大的兩類哺乳動(dòng)物，具有分布廣、種類多、種群大、并且與人類和家畜接觸密切等特點(diǎn)，已被證實(shí)是百余種人類病毒的天然宿主和儲(chǔ)存宿主，如漢坦病毒、拉沙熱病毒、尼帕病毒、埃博拉病毒和SARS冠狀病毒等。蚊和蜱是目前公認(rèn)最重要的媒介生物，它們攜帶的各種蟲媒病毒可以引起很多嚴(yán)重的人類傳染病，如登革熱、基孔肯雅熱、西尼羅腦炎、黃熱病和寨卡熱等。而且，一些動(dòng)物源性病毒和蟲媒病毒可以在不同動(dòng)物宿主和媒介生物之間交叉播散，進(jìn)一步增加了其跨種傳播的風(fēng)險(xiǎn)。

近年來(lái)，金奇課題組一直致力于闡明關(guān)鍵野生動(dòng)物及媒介生物攜帶的病毒組特征，建立完善的監(jiān)測(cè)、預(yù)警和溯源體系，從而實(shí)現(xiàn)新發(fā)傳染病防控的關(guān)口前移。通過(guò)近十年的持續(xù)努力，已經(jīng)初步揭示了我國(guó)全境范圍內(nèi)和東南亞地區(qū)代表性蝙蝠、鼠類和蚊等重要疫源生物的呼吸道和消化道病毒組特征，相關(guān)研究相繼發(fā)表于《ISME Journal》（2016）和《Microbiome》（2018、2021）等。同時(shí)，楊劍課題組通過(guò)對(duì)海量公共數(shù)據(jù)的系統(tǒng)挖掘，并輔以相關(guān)文獻(xiàn)信息的人工提取和核對(duì)校驗(yàn)，先后自主設(shè)計(jì)開發(fā)了蝙蝠相關(guān)病毒數(shù)據(jù)庫(kù)DBatVir（Database, 2014）和鼠類相關(guān)病毒數(shù)據(jù)庫(kù)DRoVir（J Genet Genomics, 2017）。

在此基礎(chǔ)上，該團(tuán)隊(duì)通過(guò)進(jìn)一步收集構(gòu)建重要媒介生物蚊和蜱相關(guān)的哺乳動(dòng)物病毒數(shù)據(jù)集，并設(shè)計(jì)開發(fā)全新的數(shù)據(jù)展示和整合分析系統(tǒng)，構(gòu)建了國(guó)際上首個(gè)重要疫源生物相關(guān)病毒數(shù)據(jù)資源平臺(tái)ZOVER（http://www.mgc.ac.cn/ZOVER）。該平臺(tái)目前共收集整理了2,100余篇文獻(xiàn)報(bào)道的近40,000個(gè)源自蝙蝠、鼠類、蚊和蜱相關(guān)樣本的哺乳動(dòng)物病毒，涉及全球150多個(gè)國(guó)家的960多種疫源生物。該數(shù)據(jù)平臺(tái)不僅收集整理了病毒樣本的關(guān)鍵元信息（如取樣時(shí)間、地點(diǎn)、樣本類型、宿主種屬、病毒檢測(cè)方法等），還整合了相關(guān)疫源生物的分布區(qū)域、親緣關(guān)系等重要信息，并提供了友好易用的界面和多種在線數(shù)據(jù)分析工具（如基因組瀏覽、比對(duì)、進(jìn)化、統(tǒng)計(jì)等）。此外，ZOVER平臺(tái)還專門開發(fā)了病毒組在線比較分析功能，可以從時(shí)間和空間等不同角度對(duì)同類宿主之間（如中華菊頭蝠和中菊頭蝠）或不同類宿主之間（如蝙蝠和鼠類）的病毒組特征進(jìn)行可視化比較分析，從而為發(fā)現(xiàn)不同疫源生物的病毒組潛在變化規(guī)律提供線索。

該研究構(gòu)建了國(guó)際上首個(gè)綜合性疫源生物相關(guān)病毒數(shù)據(jù)資源中心和分析系統(tǒng)，為未來(lái)潛在的動(dòng)物源性新發(fā)病毒性傳染病的預(yù)警、鑒定、檢測(cè)和溯源提供了整合的數(shù)據(jù)信息和綜合的分析平臺(tái)。近日，相關(guān)研究成果發(fā)表于《Nucleic Acids Research》雜志，中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院病原生物學(xué)研究所博士研究生周思宇和主管技師劉博博士為論文共同第一作者，楊劍研究員、吳志強(qiáng)研究員和陳立宏副研究員為論文共同通訊作者。該研究獲得了中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院醫(yī)學(xué)與健康科技創(chuàng)新工程項(xiàng)目資助（2020-I2M-2-001）。