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綜合新聞

孫立瑩、修樂山、張馳等在《Microbial Biotechnology》發(fā)表新冠病毒檢測與分型方法

發(fā)布日期:2022-03-03 字號:

由新冠病毒(SARS-CoV-2)引起的新型冠狀病毒肺炎(COVID-19)疫情對全球公共衛(wèi)生、社會穩(wěn)定、經(jīng)濟(jì)發(fā)展造成了前所未有的威脅。截止目前,全球累計確診病例已突破4億,死亡人數(shù)超過500萬。在嚴(yán)峻的疫情形勢下,面對新冠病毒的頻繁變異,對新冠病毒進(jìn)行識別與分型,有助于病毒快速溯源和疫情精準(zhǔn)防控。

在普遍依賴于高通量測序技術(shù)的情況下,開發(fā)操作簡便、經(jīng)濟(jì)高效的新冠病毒檢測及其變異株鑒別的方法,可以在患者出現(xiàn)臨床癥狀的早期對新冠病毒進(jìn)行快速檢測與分型,為疫情精準(zhǔn)防控提供新手段。彭俊平課題組與任麗麗課題組合作,基于高分辨率熔解曲線(high-resolution melting,HRM)技術(shù)平臺,建立了一種用于新冠病毒檢測及其變異株鑒別的快速、靈敏、低成本的方法。本方法納入了針對新冠病毒檢測的3個目標(biāo)基因及其變異株鑒別的12個突變位點,同時設(shè)置RNase P作為內(nèi)參基因,整個檢測流程僅需要2小時,即可實現(xiàn)新冠病毒的檢測及其變異株的鑒別。研究中,使用290例新冠病毒陽性臨床樣本對新方法的臨床應(yīng)用效果進(jìn)行了評估,與Sanger測序及納米孔測序的比較結(jié)果顯示,新冠病毒檢測與變異株鑒別的一致性分別為100%95.1%。使用31種呼吸道常見病原體對本方法的特異度進(jìn)行評估,結(jié)果顯示均無交叉反應(yīng),且所有靶標(biāo)的最低檢出限均低于10拷貝/反應(yīng)。此外,本方法具有較好的靈活性,隨著新冠病毒不同變異株的出現(xiàn),可以根據(jù)實際需要納入新增突變位點,為疫情防控和流行病學(xué)監(jiān)測提供了候選手段。

本研究得到中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院醫(yī)學(xué)與健康科技創(chuàng)新工程,中央高?;究蒲袠I(yè)務(wù)費和國家科技資源共享服務(wù)平臺課題的資助。

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