2022年8月，金奇教授團(tuán)隊(duì)的博士研究生耿興柱等在Frontiers in Immunology雜志發(fā)表了題為Whole Transcriptome Sequencing Reveals Neutrophils’ Transcriptional Landscape associated with Active Tuberculosis的研究論文。該研究應(yīng)用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)，系統(tǒng)比較了活動(dòng)性肺結(jié)核患者（ATB）、潛伏性結(jié)核感染者(LTBI)和健康對(duì)照者(HC)外周血中純化的中性粒細(xì)胞的基因表達(dá)譜。研究發(fā)現(xiàn)，與HC或LTBI相比，ATB患者的中性粒細(xì)胞基因表達(dá)模式發(fā)生顯著變化。功能富集分析表明，除干擾素信號(hào)通路外，ATB患者多種模式識(shí)別受體通路顯著激活，而與內(nèi)吞作用、分泌顆粒和中性粒細(xì)胞脫顆粒相關(guān)的基因表達(dá)下調(diào)，ATB患者的NF-κB 信號(hào)通路可能受到抑制等。該研究利用qPCR方法，對(duì)轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果進(jìn)行了驗(yàn)證，并對(duì)篩選出的、可作為候選診斷標(biāo)識(shí)物的差異表達(dá)基因（RBM3、CSRNP1、SRSF5）的前景進(jìn)行了評(píng)估。

結(jié)核病是威脅人類健康的主要傳染病之一，也是造成人類死亡最主要的單一慢性傳染病。細(xì)胞免疫是結(jié)核病主要的免疫保護(hù)機(jī)制之一。中性粒細(xì)胞是人體天然免疫系統(tǒng)中活躍且數(shù)量最多的細(xì)胞，也是在結(jié)核分枝桿菌侵入后募集到感染部位的天然免疫細(xì)胞之一。應(yīng)用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)，分析結(jié)核分枝桿菌感染后宿主中性粒細(xì)胞基因表達(dá)變化，既可以幫助我們了解宿主免疫應(yīng)答狀態(tài)，開展結(jié)核免疫機(jī)制研究；同時(shí)，也可以為結(jié)核病診斷標(biāo)志物的篩選提供有價(jià)值的線索。

本研工作得到中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院醫(yī)學(xué)與健康科技創(chuàng)新工程 (2021-I2M-1-037, 2016-I2M-1-013)等項(xiàng)目的資助。與深圳市第三人民醫(yī)院和河南中牟疾控中心合作，結(jié)合臨床診斷和潛伏感染現(xiàn)場(chǎng)隊(duì)列開展相關(guān)研究。金奇教授、張笑冰研究員和高磊教授為本論文共同通訊作者，博士生耿興柱和武曉琳為論文共同第一作者。

圖：三組樣本宿主外周血中性粒細(xì)胞基因差異表達(dá)分析