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綜合新聞

胡永峰、楊帆等在《Emerging Microbes & Infections》在線發(fā)表肺結(jié)核病相關(guān)肺微生物組學(xué)研究論文

發(fā)布日期:2020-06-24 字號(hào):

肺微生物組在肺結(jié)核的病理生理過(guò)程中起著重要的作用。目前只有少數(shù)基于16S rDNA擴(kuò)增子測(cè)序的研究報(bào)道,關(guān)于結(jié)核分枝桿菌和肺微生物組之間的相互作用有待進(jìn)一步深入研究。本研究利用鳥槍宏基組測(cè)序(shotgun metagenomic sequencing)系統(tǒng)分析比較了30例結(jié)核分枝桿菌陽(yáng)性 (MTB+) 30例結(jié)核分枝桿菌陰性(MTB-)肺結(jié)核患者支氣管肺泡灌洗液(BAL)的肺微生物組。

MTB+ 患者肺微生物組Alpha多樣性相比MTB-患者顯著降低。MTB+患者和MTB-患者肺微生物組Beta多樣性存在顯著差異。MTB+肺微生物組以MTB為主,而MTB-微生物組中富含Streptococcus, Prevotella, Nesseria, Selenomonas Bifidobacterium接近健康人肺微生物組成。網(wǎng)絡(luò)(Network analysis)分析表明MTB對(duì)肺微生物群落結(jié)構(gòu)有顯著影響。MTB+MTB-群落表現(xiàn)出明顯的差異性功能特征。肺部真菌微生物群落也與結(jié)核分枝桿菌的存在與否有關(guān)。此外,本研究對(duì)16S rDNA擴(kuò)增子測(cè)序和鳥槍宏基組測(cè)序方法進(jìn)行了比較,結(jié)果證實(shí)了16S rDNA擴(kuò)增子測(cè)序嚴(yán)重低估了微生物組中結(jié)核桿菌的豐度,不適合肺結(jié)核桿菌相關(guān)微生物組學(xué)研究。

本研究首次利用宏基因組測(cè)序技術(shù)探索結(jié)核分枝桿菌與宿主菌群之間的相互作用。MTB+患者的肺微生物組中以MTB為主,而MTB-患者的肺微生物組中以鏈球菌富集為主。

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